Uno de los puntos críticos que genera polémica es la exclusión del 17% del padrón electoral, aproximadamente 1.5 millones de votantes, quienes no estarán representados en los resultados preliminares del Sirepre. Este grupo está conformado por el 8% de actas que presentan observaciones técnicas que deben ser revisadas manualmente por tribunales departamentales, el 5% del voto exterior y el 4% correspondiente a zonas rurales excluidas donde no hay acceso a internet para la transmisión.