Flores fue magistrado del Tribunal Constitucional y cuestionado por avalar la reelección indefinida del presidente Evo Morales.

“Mediante la presente tengo a bien comunicar, para su conocimiento y fines consiguientes, que la señora Fabiola Elena Meneses Gómez, jefe de Unidad de Análisis Jurídico, asumirá funciones como Directora General de Asuntos Jurídicos a.i. a partir del 12 de junio del año en curso, hasta la designación del nuevo titular”, se lee en la nota interna emitida por la directora general de Asuntos Administrativos, Martha Patricia Arcani Acarapi.

Flores fue posesionado en la Dirección de Asuntos Jurídicos el 15 de febrero de este año en medio de críticas de legisladores de la oposición que consideraron la designación como "un pago" del Gobierno por el respaldo a la reelección indefinida de Morales.