La nueva presidenta del Tribunal Supremo Electoral (TSE), María Eugenia Choque, fue viceministra de Políticas y Gestión de Tierras Altas durante el gobierno del expresidente Carlos Mesa.
La información está incluida en el Decreto Supremo 27709 del septiembre de 2004, mediante el cual Choque incluso fue designada como ministra interina de Asuntos Indígenas y Pueblos Originarios por un viaje que realizó el entonces ministro Ricardo Calla, que era titular de esta cartera.
Esta situación fue observada por el diputado de Unidad Demócrata (UD), Wilson Santamaría, quien aclaró que "no es delito haber sido autoridad", pero "que algo raro está pasando". 
Ante la sorpresiva renuncia de la ahora expresidenta del Tribunal Electoral, Katia Uriona, Choque asumió ese cargo asegurando que no tiene ningún tipo de acercamiento con el actual Gobierno y que tiene una amplia experiencia en el ámbito de la defensa de los pueblos indígenas.